Mitsuha yra mažo kalnų miestelio mero duktė. Ji - paprasta vidurinės mokyklos mokinė, gyvenanti su seserimi ir močiute ir be jokių skrupulų leidžianti suprasti, kad jai neįdomūs šintoistiniai ritualai ar pagalba tėvo rinkimų kampanijai. Vietoj to ji svajoja palikti nuobodų miestelį...
„5 centimetrai per sekundę“ - trijų dalių pasakojimas apie tai, kaip geriausi draugai Takakis ir Akari po pradinės mokyklos baigimo yra priversti išsiskirti. Puoselėdami romantiškus jausmus, jaunuoliai susirašinėja, kol galiausiai vieną žiemos dieną Takakis sėda į traukinį ir...